شناسایی ژنتیکی انگل نماتودیرلا کملی بر اساس ژن میتوکندریایی سیتوکروم اکسیداز تحت واحد یک (co۱) و ژن ریبوزومی ۱۸s rdna
نویسندگان
چکیده
مقدمه و هدف: نماتودیرلا کملی یکی از انگلهای دستگاه گوارش نشخوارکنندگان است این انگل از نظر شباهتهای مورفولوژیکی بسیار شبیه به جنس نماتودیروس میباشد آنالیز فیلوژنیک نماتودیرلا کملی بر اساس ترادف its1 و its2 حاکی از ارتباط بسیار نزدیک این گونه با بعضی گونه های نماتودیروس است و می توان اظهار داشت که گونه نماتودیرلا کملی به جنس نماتودیروس شباهت زیاد دارد، و تعریف یک جنس جداگانه به نام نماتودیرلا کملی شاید تنها بر اساس یافته های مورفولوژیک مورد سوال قرار گیرد، جهت بررسی بیشتر این موضوع شناسایی و آنالیز ژن میتوکندریایی co1 و ژن ریبوزومی 18s rdna این انگل برای اولین بار مورد مطالعه قرار گرفت. مواد و روش کار: تعداد 11 نمونه انگلی جدا شده از دو شتر آلوده جمع آوری شد و پس از مطالعات مورفولوژیک و تایید گونه انگلی، نمونه ها توسط پنس استریل کاملا له گردیدند، dna نمونه ها با استفاده از کیت تجاری استخراج dna استخراج شد. و سپس با استفاده از پرایمرهای مناسب و محلول dntp، بافر 10x pcr و محلول mgcl2 نمونه ها در دستگاه ترموسایکلر با سیکل های حرارتی-زمانی قرار داده شد. فرآورده pcr روی ژل آگارز، الکتروفورز گردید و پس از رنگ آمیزی با اتیدیوم بروماید، باندهای بدست آمده با ایلومیناتور uv مشاهده و نتایج ثبت شد. پس از تکثیر موفقیت آمیز ژنهای هدف ، محصولات هر واکنش بصورت جداگانه از دو طرف تعیین ترادف شد. در پایان نتایج نهایی و استخراج شده حاصل از سکانس انگل در میزبان شتر، با استفاده از برنامه blast n مورد بررسی و مقایسه ی با دیگر موارد مشابه موجود در بانک ژن آمریکا (ncbi) قرار گرفت تا هر گونه قرابت و اختلاف بین جدایه های این انگل در شتر با سایر موارد مشابه در دیگر میزبانها مشخص گردد. در ضمن موقعیت فیلوژنی این انگل در ارتباط با سایر گونه های ثبت شده از لحاظ ژن های مذکور پس از ترسیم درخت فیلوژنی به کمک نرم افزار mega.4 مورد مقایسه گرفت. نتایج و بحث: اطلاعات به دست آمده براساس ژن 18s rdna نشان داد که بین نماتودیرلا کملی(jx305977) و نماتودیروس باتوس(aj920360,u01230) شباهت 99 درصدی وجود دارد. تمامی سکانس های ناحیه ریبوزومی18s rdna برای انگل های مورد مطالعه از شباهت صددرصدی برخوردار بود. بررسی ملکولی بر اساس ژن میتوکندریاییco1، ی(x305966 تا jx305976) حاکی از وجود اختلاف ژنتیکی درون گونه ای و حضور 11 ژنوتیپ مختلف در میان 11 نمونه انگلی مورد بررسی بود. بر اساس ژن میتوکندریایی میزان اختلاف ژنتیکی درون گونه ای 1 تا 3 درصد برآورد گردید. در مقایسه ای که بین ترادف co1 ایزوله های انگلی نماتودیرلا کملی صورت گرفت، 32 جایگاه نوکلئوتیدی دارای پلی مورفیسم درون گونه ای بود. بنابراین می توان گفت ژن میتوکندریایی co1 برای بررسی ژنتیک جمعیت نماتودیرلا کملی نسبت به ناحیه ریبوزومی 18s rdna مناسب تر است.
منابع مشابه
شناسایی ژنتیکی انگل نماتودیرلا کملی بر اساس ژن میتوکندریایی سیتوکروم اکسیداز تحت واحد یک (CO1) و ژن ریبوزومی 18S rDNA
مقدمه و هدف: نماتودیرلا کملی یکی از انگلهای دستگاه گوارش نشخوارکنندگان است این انگل از نظر شباهتهای مورفولوژیکی بسیار شبیه به جنس نماتودیروس میباشد آنالیز فیلوژنیک نماتودیرلا کملی بر اساس ترادف ITS1 و ITS2 حاکی از ارتباط بسیار نزدیک این گونه با بعضی گونههای نماتودیروس است و میتوان اظهار داشت که گونه نماتودیرلا کملی به جنس نماتودیروس شباهت زیاد دارد، و تعریف یک جنس جداگانه به نام نماتود...
متن کاملجداسازی ، همسانهسازی و آنالیزهای بیوانفورماتیکی زیر واحد I ژن سیتوکروم اکسیداز C در مرکبات
سیتوکروم اکسیدازc، کمپلکس پروتئینی در غشاء داخلی میتوکندری یوکاریوت ها و غشاء پلاسمایی پروکاریوت های هوازی است که به عنوان آخرین آنزیم در چرخه انتقال الکترون به اکسیژن ایفای نقش میکند. سیتوکرم اکسیدازc در ساختار خود 3 زیر واحد (2،1 و 3) دارد. در این مطالعه زیر واحد 1 سیتوکروم سی اکسیداز متعلق به پرتقال Citrus sciences بررسی شد. به این منظور پس از طراحی آغازگرهای اختصاصی بر اساس توالیهای حاصل ...
متن کاملغربالگری پلی مرفیسم های جدید زیرواحد1 ژن آنزیم سیتوکروم اکسیداز میتوکندریایی در بیماران مبتلا به انسداد مزمن ریوی
سابقه و هدف: بیماری انسداد مزمن ریوی(COPD) از التهاب و تخریب بخشهایی از بافت ریه به وجود می آید و معمولاً افراد را در سنین بالای 50 سال مبتلا می نماید. . با توجه به اینکه مشکل اصلی این بیماران ضعف در انجام کارهای فیزیکی به دلیل بروز تنگی نفس و کمبود انرژی است این سوال مطرح می شود که آیا تغیییرات در آنزیم سیتوکروم اکسیداز(COX) به عنوان آخرین و مهمترین جزء زنجیره تنفسی می تواند در بروز این بیماری ...
متن کاملبررسی فیلوژنیک عقرب(Scorpions: Buthidae) Mesobuthus eupeus با استفاده از توالی ژن سیتوکروم اکسیداز زیرواحد 1 میتوکندریایی در استان خوزستان
تعداد 10 عقرب مزوبوتوس اپئوس از منطقه باغملک استان خوزستان صید و پس از شناسایی درآزمایشگاه رفرانس عقرب موسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی اهواز بمنظور استخراج DNA به روش دستی فنل/کلروفرم به آزمایشگاه بیولوژی ملکولی دانشکده دامپزشکی شهید چمران اهواز منتقل گردید. تعداد ده نمونه به کمک PCR ژن سیتوکروم اکسیداز زیر واحد 1 ( (COXI با اندازه623 نوکلئوتید با استفاده از آغازگرهای رفت و برگشت تکثیر گر...
متن کاملبررسی ژنتیکی شوورت ماهی نقره ای Sillago sihama در آبهای شمال خلیج فارس بر پایه توالی ژن سیتوکروم اکسیداز C زیر واحد I
خانواده شوورت ماهیان (Sillaginids) از راسته سوف ماهی سانان (Perciformes)، نامزد مناسبی برای آبزی پروری در مناطق مصبی و کم عمق به شمار می روند. این خانواده دارای دست کم سه گونه در آبهای خلیج فارس می باشد. بررسی ژنتیکی گونه غالب این خانواده، شوورت ماهی نقره ای Sillago sihama با استفاده از ژن COI مورد ارزیابی قرار گرفت. در این بررسی، تعداد 10 نمونه از گونه مورد نظر از سواحل هر یک از استان های بوشه...
متن کاملتنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA
میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونههای میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمعآوری شدند و برای توالییابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینهسازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالییابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
فصلنامه دامپزشکی و آزمایشگاهجلد ۴، شماره ۱، صفحات ۵۸-۵۸
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023